Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD53P19397 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD53P19397 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD53P19397 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms