Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT4P19013 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT4P19013 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms