Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB1P16220 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms