Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAV1P15498 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAV1P15498 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAV1P15498 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAV1P15498 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAV1P15498 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms