Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPBP14678 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms