Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEFHP12036 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms