Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HKR1P10072 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HKR1P10072 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HKR1P10072 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms