Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms