Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF1P09603 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF1P09603 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF1P09603 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF1P09603 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF1P09603 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF1P09603 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms