Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD2O96028 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD2O96028 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NSD2O96028 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD2O96028 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD2O96028 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms