Protein–RNA interactions for Protein: O95755

RAB36, Ras-related protein Rab-36, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB36O95755 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB36O95755 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB36O95755 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB36O95755 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB36O95755 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB36O95755 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB36O95755 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB36O95755 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB36O95755 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB36O95755 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms