Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POP4O95707 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POP4O95707 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POP4O95707 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POP4O95707 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POP4O95707 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POP4O95707 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POP4O95707 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POP4O95707 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POP4O95707 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POP4O95707 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POP4O95707 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POP4O95707 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POP4O95707 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POP4O95707 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms