Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms