Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAPBO95292 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPBO95292 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPBO95292 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPBO95292 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPBO95292 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPBO95292 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPBO95292 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPBO95292 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPBO95292 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPBO95292 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPBO95292 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPBO95292 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAPBO95292 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAPBO95292 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAPBO95292 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms