Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL3O95236 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL3O95236 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL3O95236 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL3O95236 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL3O95236 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms