Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG12O94817 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATG12O94817 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATG12O94817 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG12O94817 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG12O94817 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG12O94817 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATG12O94817 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG12O94817 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms