Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP2O75323 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms