Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5O75197 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5O75197 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5O75197 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5O75197 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5O75197 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5O75197 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5O75197 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5O75197 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5O75197 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5O75197 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRP5O75197 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5O75197 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5O75197 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP5O75197 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP5O75197 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP5O75197 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP5O75197 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP5O75197 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP5O75197 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP5O75197 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms