Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms