Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GMDSO60547 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMDSO60547 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms