Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LY75O60449 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY75O60449 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LY75O60449 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LY75O60449 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY75O60449 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY75O60449 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY75O60449 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms