Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms