Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC4O15439 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms