Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGFO15240 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGFO15240 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGFO15240 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VGFO15240 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VGFO15240 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VGFO15240 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VGFO15240 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VGFO15240 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VGFO15240 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VGFO15240 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VGFO15240 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VGFO15240 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VGFO15240 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VGFO15240 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VGFO15240 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VGFO15240 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
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