Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNPHO15079 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SNPHO15079 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNPHO15079 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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