Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM6BO15054 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM6BO15054 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms