Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD1AO15047 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms