Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLGNO14967 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLGNO14967 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLGNO14967 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLGNO14967 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLGNO14967 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLGNO14967 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLGNO14967 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLGNO14967 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLGNO14967 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLGNO14967 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms