Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APAF1O14727 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APAF1O14727 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms