Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELL2O00472 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELL2O00472 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELL2O00472 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELL2O00472 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELL2O00472 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELL2O00472 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELL2O00472 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELL2O00472 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELL2O00472 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ELL2O00472 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELL2O00472 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELL2O00472 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELL2O00472 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELL2O00472 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms