Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLRMTO00411 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms