Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms