Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD3A6NKT7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms