Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWA3AA6NCI4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms