Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms