Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms