Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms