Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2J1Q9Y385 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2J1Q9Y385 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2J1Q9Y385 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2J1Q9Y385 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2J1Q9Y385 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2J1Q9Y385 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2J1Q9Y385 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms