Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms