Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms