Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms