Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms