Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms