Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms