Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms