Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DKK4Q9UBT3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms