Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPARGC1AQ9UBK2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms