Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABI3Q9P2A4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms