Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms