Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms